Transplantasi Ginjal merupakan pilihan utama pengobatan bagi pasien gagal ginjal kronis, namun hingga saat ini pusat transplantasi ginjal di Indonesia masih sangat terbatas terutama karena belum lengkapnya fasilitas medik dan SDM terlatih yang dimiliki Rumah Sakit. Oleh karena itu Pemerintah telah menitikberatkan perhatian pada pengembangan jaringan pusat transplantasi ginjal di Indonesia yang meliputi beberapa rumah sakit besar seperti RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo, Jakarta.

Sebagai pusat rujukan nasional, RSUPN Dr. Cipto Mangunkusumo memiliki sumber daya dokter spesialis yang paling lengkap di Indonesia. Dokter-dokter tersebut telah mengenyam pendidikan dan pelatihan terkait transplantasi ginjal di Eropa. Layanan transplantasi ginjal dikelola secara terpadu dengan memberikan pelayanan multidisipliner yang paripurna dalam menangani pasien penyakit ginjal, sehingga pengurangan angka kematian dan peningkatan kualitas hidup pasien dapat tercapai.

Operasi transplantasi telah mulai dikerjakan di RSCM sejak tahun 2010. Hingga tahun Desember 2015, telah dilakukan lebih dari 300 operasi transplantasi ginjal dengan angka keberhasilan diatas 85%. Sampai dengan saat ini, tim transplantasi ginjal FKUI-RSCM aktif memberikan bimbingan pada rumah sakit lain yang ingin mengembangkan transpalntasi ginjal di Indonesia.