Endourologi merupakan salah satu layanan unggulan dari Urologi di RSCM, di mana ini merupakan suatu teknik minimal invasif yang dapat menjadi pilihan tatalaksana terhadap batu saluran kemih. Batu dapat dikeluarkan atau dipecahkan menjadi pecahan-pecahan kecil menggunakan instrumen kecil melalui saluran uretra, kandung kemih dan ureter. Instrumen-instrumen yang berukuran kecil dan fleksibel ini dapat berupa laser, pemecah batu pneumatik, mekanik, kantung penangkap pecahan batu, dan kauter.